В марте 2001 года утверждена Программа профсоюзного образования Федерации профсоюзов РС(Я).
В сентябре 2002 года при Федерации профсоюзов РС(Я) создан Молодежный совет, который возглавил Петр Желобцов.
2 февраля 2005 года Советом Федерации профсоюзов Республики Саха (Якутия) председателем Федерации профсоюзов Республики Саха (Якутия) избрана Е.С.Томская.
21 декабря 2005 года состоялась XXII отчетно-выборная конференция профсоюзов. Председателем Федерации избран народный депутат Республики Саха (Якутия) А.Н.Ким-Кимэн.
4 октября 2006 года постановлением Исполкома Федерации профсоюзов Республики Саха (Якутия) утвержден знак «За вклад в развитие профсоюзного движения Якутии».
14 февраля 2007 года Государственным Собранием (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия) принят в окончательном чтении Конституционный закон Республики Саха (Якутия) «О внесении дополнений в Конституцию (Основной закон) Республики Саха (Якутия)», в соответствии с которым Федерация профсоюзов Республики Саха (Якутия) получила право законодательной инициативы.
1-2 июля 2007 года состоялись финальные соревнования I Спартакиады трудовых коллективов Республики Саха (Якутия), посвященной 375-летию вхождения Якутии в состав Российского государства.
21 сентября 2007 года принято первое республиканское (региональное) соглашение «О минимальной заработной плате в Республике Саха (Якутия)», в соответствии с которым минимальная заработная плата установлена в размере 3500 рублей.
28 октября 2008 года подписано очередное соглашение о повышении с 1 января 2009 года размера минимальной заработной платы в Республике Саха (Якутия) до 5130 рублей.
3-4 апреля 2008 года по инициативе Федерации профсоюзов РС(Я) при поддержке Общественной палаты РФ проведены общественные слушания по теме «Актуальные проблемы защиты социально-трудовых прав работающих в регионах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях» с участием Комиссии Общественной палаты РФ по трудовым отношениям и пенсионному обеспечению.
16-19 декабря 2008 года проведен заключительный этап I Фестиваля художественного творчества трудовых коллективов Республики Саха (Якутия) «Славим трудом край Олонхо!».
19 февраля 2009 года Государственным Собранием (Ил Тумэн) Республики Саха (Якутия) принят Закон Республики Саха (Якутия) «О территориальных трехсторонних комиссиях по регулированию социально-трудовых отношений в Республике Саха (Якутия)».
27 апреля 2011 года Указом Президента РС(Я) Е,А.Борисова №626 установлен День профсоюзного работника в Республике Саха (Якутия), отмечаемый ежегодно 27 ноября.
23 ноября 2011 года Распоряжением Президента Республики Саха (Якутия) Е.А.Борисова №861-РП учреждена Книга Почета лучших трудовых династий Республики Саха (Якутия).
11 февраля 2012 года проведен Митинг «За человека труда!».
28-30 июня 2012 года состоялся IV Республиканский форум профсоюзной молодежи.
7 сентября 2012 года – Подписано Республиканское (Региональное) соглашение «О минимальной заработной плате в Республике Саха (Якутия)», в соответствии с которым минимальная заработная плата с 1 сентября 2012 г. установлена в размере 8544 рублей.
21-30 ноября 2012 года – Декада, посвященная Дню профсоюзного работника в Республике Саха (Якутия).
23 ноября 2012 года – IV отчетно-выборная конференция Молодежного совета Федерации профсоюзов Республики Саха (Якутия).
30 ноября 2012 года – Состоялось торжественное собрание, посвященное Дню профсоюзного работника в Республике Саха (Якутия).
30 ноября 2012 года – Гала-концерт лауреатов II Фестиваля художественного творчества трудовых коллективов Республики Саха (Якутия) под девизом «Славим дружбой и трудом край Олонхо!».
21-23 июня 2013 года – V Республиканский форум профсоюзной молодежи.
7-9 сентября 2013 года участие сборной команды Республики Саха (Якутия) в финальных соревнованиях II Спартакиады трудовых коллективов Российской Федерации в г. Йошкар-Ола.
19 сентября 2013 года между Правительством Республики Саха (Якутия), Федерацией профсоюзов Республики Саха (Якутия) и Республиканским объединением работодателей было подписано Республиканское соглашение «О минимальной заработной плате в Республике Саха (Якутия), согласно которого с 1 сентября 2013 года размер минимальной заработной платы установлен в сумме 10540 рублей.
1-29 ноября 2013 года – Месячник, посвященный Дню профсоюзного работника в Республике Саха (Якутия).
15 ноября 2013 года – День бесплатной юридической помощи населению города и республики.
16 ноября 2013 года – Республиканские соревнования «Папа, мама и я –спортивная семья» среди профсоюзной молодежи.
20 ноября 2013 года – Республиканская научно-практическая конференция «Состояние и пути развития профсоюзного движения на современном этапе».
29 ноября 2013 года – Торжественное собрание общественности, посвященное Дню профсоюзного работника в Республике Саха (Якутия).
29 ноября 2013 года – Презентация книги «Авангард профсоюзов Якутии» о работе лучших первичных профсоюзных организаций.
18 декабря 2013 года – Учредительная конференция Якутской республиканской организации Профсоюза работников физической культуры, спорта и туризма РФ
14 января 2014 года - Подписано Республиканское (региональное) соглашение «О минимальной заработной плате в Республике Саха (Якутия)», в соответствии с которым минимальная заработная плата с 1 января 2014 г. установлена в размере 12515 руб.
26 марта 2014 года - Республиканский семинар для профактива «Информационные технологии в деятельности современных профсоюзов» с участием руководителя Департамента общественных связей ФНПР Корнеева В.О.
17-23 мая 2014 года - Сортировщик алмазного сырья ЯПТА «АЛРОСА» Анастасия Слепцова представила Молодежный совет Федерации профсоюзов Республики Саха (Якутия) на 3-м Всемирном Конгрессе Международной конфедерации профсоюзов (МКП) (г.Берлин, Германия).
